植物生长需要合适的温度和湿度。与此对应，PC阳光板温室需要通风系统来调节和控制室内的温度和湿度，为植物提供适宜的生长环境。通常，PC阳光板温室通风系统可以分为自然通风和强制通风两种。所谓自然通风即通过开启PC阳光板温室的侧窗或者天窗，利用PC阳光板温室内外温度差异或者风压，实现PC阳光板温室内外空气对流，降低阳光板温室内的温度、湿度防雾滴阳光板。所谓强制通风即通过启动风机等迫使PC阳光板温室内外空气对流，调节阳光板温室内的温度和湿度。两种通风方式各有特点，适用于不同的情形。

随着单体阳光板温室面积的不断扩大，对于提高阳光板温室通风能力，天窗比侧窗效果要好得多。借助开窗系统，阳光板温室侧窗和天窗可以根据需要开启或关闭。阳光板温室侧窗通常为连续窗，如果阳光板温室覆盖了玻璃、PC板等比较坚硬的材料，则采用连续齿轮齿条系统驱动；如果是薄膜等软材料，则可采用卷膜开窗系统。还有一个选择是使用充气保利窗，即通过气囊充气或放气，实现保利窗的闭合和开启。阳光板温室天窗可以设计成沿阳光板温室屋脊连续开启或者断续开启。